Да, включается. То есть, если Ваш хостинг-пакет включает 200 Мб, 10Мб из которых занято почтовыми сообщениями, то на сам сайт останется 190 Мб. Поэтому советуем следить за заполненностью Вашей почты и своевременно удалять сообщения с почты на хостинге. Также Вы можете установить в настройках почтового клиента (например в Outlook) удалять сообщения с сервера после приема.